RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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a
DuplicatedSeedCache
(
RDKit::FMCS
)
k
MolFragment
(
RDKit::FMCS
)
RingMatchTableSet
(
RDKit::FMCS
)
e
MolHistogram
(
RDKit::MolAlign
)
ROMol
(
RDKit
)
AdjustQueryParameters
(
RDKit::MolOps
)
KeyErrorException
MolHolder
(
RDKit
)
RWMol
(
RDKit
)
And
(
RDKit::FilterMatchOps
)
EleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
SubstructureCache::KeyNumericMetrics
(
RDKit::FMCS
)
MolHolderBase
(
RDKit
)
RxnSanitizeException
(
RDKit
)
AndQuery
(
Queries
)
EmbeddedAtom
(
RDDepict
)
l
MolPickler
(
RDKit
)
s
AngleBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
EmbeddedFrag
(
RDDepict
)
MolPicklerException
(
RDKit
)
AngleBendContrib
(
ForceFields::UFF
)
EmbedParameters
(
RDKit::DGeomHelpers
)
LAP
(
RDKit::MolAlign
)
MolSanitizeException
(
RDKit
)
SDM
(
RDKit::MolAlign
)
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
EnumerateLibrary
(
RDKit
)
larger_of
(
RDKit
)
MolStackElem
(
RDKit::Canon
)
SDMolSupplier
(
RDKit
)
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
EnumerateLibraryBase
(
RDKit
)
LessEqualQuery
(
Queries
)
MolStackUnion
(
RDKit::Canon
)
SDWriter
(
RDKit
)
argless
(
Rankers
)
EnumerationParams
(
RDKit
)
LessQuery
(
Queries
)
MolSupplier
(
RDKit
)
Seed
(
RDKit::FMCS
)
AromaticAtomIterator_
(
RDKit
)
EnumerationStrategyBase
(
RDKit
)
Ligand
(
RDKit::StructureCheck
)
MolWriter
(
RDKit
)
SeedSet
(
RDKit::FMCS
)
Atom
(
RDKit
)
EnumerationStrategyException
(
RDKit
)
LinearCatalog
(
RDCatalog
)
MultiFPBReader
(
RDKit
)
SetQuery
(
Queries
)
AtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
EqualityQuery
(
Queries
)
LocaleSwitcher
(
RDKit::Utils
)
n
SLNParseException
(
RDKit
)
atomicData
(
RDKit
)
EvenSamplePairsStrategy
(
RDKit
)
ltDouble
(
RDKit
)
SmartsMatcher
(
RDKit
)
AtomicParams
(
ForceFields::UFF
)
ExclusionList
(
RDKit
)
m
Neighbourhood
(
RDKit::StructureCheck
)
SmilesMolSupplier
(
RDKit
)
AtomIterator_
(
RDKit
)
ExecStatistics
(
RDKit::FMCS
)
NewBond
(
RDKit::FMCS
)
SmilesParseException
(
RDKit
)
AtomMonomerInfo
(
RDKit
)
ExplicitBitVect
MatchingAtomIterator_
(
RDKit
)
Not
(
RDKit::FilterMatchOps
)
SmilesParserParams
(
RDKit
)
AtomPDBResidueInfo
(
RDKit
)
ExplicitFeature
(
RDFeatures
)
Matrix
(
RDNumeric
)
o
SmilesWriter
(
RDKit
)
AtomRingQuery
(
RDKit
)
f
MaximumCommonSubgraph
(
RDKit::FMCS
)
Snapshot
(
RDKit
)
AttribType
(
RDKit::SLNParse
)
MaxMinPicker
(
RDPickers
)
O3A
(
RDKit::MolAlign
)
SparseBitVect
AugmentedAtom
(
RDKit::StructureCheck
)
FeatureFileParseException
(
RDKit
)
MaxMinPickInfo
(
RDPickers
)
O3AConstraint
(
RDKit::MolAlign
)
SparseIntVect
(
RDKit
)
b
FileParseException
(
RDKit
)
MCSAtomCompareParameters
(
RDKit
)
O3AConstraintVect
(
RDKit::MolAlign
)
SpecialChiralityAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
FilterCatalog
(
RDKit
)
MCSBondCompareParameters
(
RDKit
)
O3AFuncData
(
RDKit::MolAlign
)
SpecialSymmetryAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
BadFileException
(
RDKit
)
FilterCatalogEntry
(
RDKit
)
MCSParameters
(
RDKit
)
OopBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
SquareMatrix
(
RDNumeric
)
BitCorrMatGenerator
(
RDInfoTheory
)
FilterCatalogParams
(
RDKit
)
MCSProgressData
(
RDKit
)
Or
(
RDKit::FilterMatchOps
)
streambuf
(
boost_adaptbx::python
)
BitVect
FilterData_t
(
RDKit
)
MCSResult
(
RDKit
)
OrQuery
(
Queries
)
streambuf_capsule
(
boost_adaptbx::python
)
Bond
(
RDKit
)
FilterHierarchyMatcher
(
RDKit
)
MetricMatrixCalc
(
RDDataManip
)
streambuf::ostream
(
boost_adaptbx::python
)
StretchBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
bondholder
(
RDKit::Canon
)
FilterMatch
(
RDKit
)
MMFFAngle
(
ForceFields::MMFF
)
ostream
(
boost_adaptbx::python
)
StructChecker
(
RDKit::StructureCheck
)
BondIterator_
(
RDKit
)
FilterMatcherBase
(
RDKit
)
MMFFAngleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
p
StructCheckerOptions
(
RDKit::StructureCheck
)
BondStretchContrib
(
ForceFields::MMFF
)
FilterProperty_t
(
RDKit
)
MMFFAromCollection
(
ForceFields::MMFF
)
StructCheckTautomer
(
RDKit::StructureCheck
)
BondStretchContrib
(
ForceFields::UFF
)
ForceField
(
ForceFields
)
MMFFAtomProperties
(
RDKit::MMFF
)
Dict::Pair
(
RDKit
)
SubstructLibrary
(
RDKit
)
BoundsMatrix
(
DistGeom
)
ForceFieldContrib
(
ForceFields
)
MMFFBndkCollection
(
ForceFields::MMFF
)
pairGreater
(
Rankers
)
SubstructureCache
(
RDKit::FMCS
)
c
ForwardSDMolSupplier
(
RDKit
)
MMFFBond
(
ForceFields::MMFF
)
pairLess
(
Rankers
)
SymmMatrix
(
RDNumeric
)
FourthDimContrib
(
DistGeom
)
MMFFBondCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ParamCollection
(
ForceFields::UFF
)
t
CachedMolHolder
(
RDKit
)
FPBReader
(
RDKit
)
MMFFChg
(
ForceFields::MMFF
)
PathEntry
(
RDKit::StructureCheck
)
CachedSmilesMolHolder
(
RDKit
)
FPHolderBase
(
RDKit
)
MMFFChgCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PatternHolder
(
RDKit
)
Target
(
RDKit::FMCS
)
CachedTrustedSmilesMolHolder
(
RDKit
)
FragCatalogEntry
(
RDKit
)
MMFFCovRadPauEle
(
ForceFields::MMFF
)
PDBMolSupplier
(
RDKit
)
TargetMatch
(
RDKit::FMCS
)
canon_atom
(
RDKit::Canon
)
FragCatGenerator
(
RDKit
)
MMFFCovRadPauEleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PDBWriter
(
RDKit
)
TArray2D
(
RDKit::FMCS
)
CartesianProductStrategy
(
RDKit
)
FragCatParams
(
RDKit
)
MMFFDef
(
ForceFields::MMFF
)
PeriodicTable
(
RDKit
)
TDTMolSupplier
(
RDKit
)
Catalog
(
RDCatalog
)
FragFPGenerator
(
RDKit
)
MMFFDefCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Point
(
RDGeom
)
TDTWriter
(
RDKit
)
CatalogEntry
(
RDCatalog
)
FragmenterBondType
(
RDKit::MolFragmenter
)
MMFFDfsbCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Point2D
(
RDGeom
)
DuplicatedSeedCache::TKey
(
RDKit::FMCS
)
CatalogParams
(
RDCatalog
)
FreeChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
MMFFHerschbachLaurie
(
ForceFields::MMFF
)
Point3D
(
RDGeom
)
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ChargeFix
(
RDKit::StructureCheck
)
g
MMFFHerschbachLaurieCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PointND
(
RDGeom
)
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::UFF
)
charptr_functor
(
RDKit
)
MMFFMolProperties
(
RDKit::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
TorsionAngleContribM6
(
ForceFields::CrystalFF
)
ChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
GasteigerParams
(
RDKit
)
MMFFOop
(
ForceFields::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ChemicalReaction
(
RDKit
)
Graph
(
RDKit::FMCS
)
MMFFOopCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Properties
(
RDKit::Descriptors
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
ChemicalReactionException
(
RDKit
)
GreaterEqualQuery
(
Queries
)
MMFFPBCI
(
ForceFields::MMFF
)
PropertyFunctor
(
RDKit::Descriptors
)
Trajectory
(
RDKit
)
ChemicalReactionParserException
(
RDKit
)
GreaterQuery
(
Queries
)
MMFFPBCICollection
(
ForceFields::MMFF
)
PySequenceHolder
Transform2D
(
RDGeom
)
ChiralAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
Grid3D
(
RDGeom
)
MMFFProp
(
ForceFields::MMFF
)
q
Transform3D
(
RDGeom
)
ChiralSet
(
DistGeom
)
GridException
(
RDGeom
)
MMFFPropCollection
(
ForceFields::MMFF
)
u
ChiralViolationContrib
(
DistGeom
)
gtIIPair
(
RDDepict
)
MMFFStbn
(
ForceFields::MMFF
)
Query
(
Queries
)
Composition2N
(
RDKit::FMCS
)
h
MMFFStbnCollection
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtom
(
RDKit
)
UFFAngle
(
ForceFields::UFF
)
Conformer
(
RDKit
)
MMFFTor
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtomIterator_
(
RDKit
)
UFFBond
(
ForceFields::UFF
)
ConformerException
(
RDKit
)
SubstructureCache::HashKey
(
RDKit::FMCS
)
MMFFTorCollection
(
ForceFields::MMFF
)
QueryBond
(
RDKit
)
UFFInv
(
ForceFields::UFF
)
ConstBondIterator_
(
RDKit
)
HashSet
(
RDKit::MolHash
)
MMFFVdW
(
ForceFields::MMFF
)
r
UFFTor
(
ForceFields::UFF
)
CrippenParamCollection
(
RDKit::Descriptors
)
HasPropQuery
(
RDKit
)
MMFFVdWCollection
(
ForceFields::MMFF
)
UFFVdW
(
ForceFields::UFF
)
CrippenParams
(
RDKit::Descriptors
)
HasPropWithValueQuery
(
RDKit
)
MMFFVdWRijstarEps
(
ForceFields::MMFF
)
RandomSampleAllBBsStrategy
(
RDKit
)
UniformGrid3D
(
RDGeom
)
d
HasPropWithValueQuery< TargetPtr, std::string >
(
RDKit
)
MolAlignException
(
RDKit::MolAlign
)
RandomSampleStrategy
(
RDKit
)
v
HeteroatomIterator_
(
RDKit
)
MolBundle
(
RDKit
)
RangeQuery
(
Queries
)
Data3Ddescriptors
HierarchCatalog
(
RDCatalog
)
MolCatalogEntry
(
RDKit
)
RDAny
(
RDKit
)
Value
(
RDKit::RDTypeTag::detail
)
DatastructsException
HierarchicalClusterPicker
(
RDPickers
)
MolCatalogParams
(
RDKit
)
rdLogger
(
boost::logging
)
ValueErrorException
DefaultTorsionBondSmarts
(
RDKit::MMFF::Tools
)
i
MolChemicalFeature
(
RDKit
)
RDProps
(
RDKit
)
VdWContrib
(
ForceFields::MMFF
)
DefaultTorsionBondSmarts
(
RDKit::UFF::Tools
)
MolChemicalFeatureDef
(
RDKit
)
RDValue
(
RDKit
)
vdWContrib
(
ForceFields::UFF
)
DepictException
(
RDDepict
)
ImplicitFeature
(
RDFeatures
)
MolChemicalFeatureFactory
(
RDKit
)
ReactionFingerprintParams
(
RDKit
)
Vector
(
RDNumeric
)
Dict
(
RDKit
)
IncEntry
(
RDKit::StructureCheck
)
MolData3Ddescriptors
ReactionPickler
(
RDKit
)
HierarchCatalog::vertex_entry_t
(
RDCatalog
)
DiscreteDistMat
(
RDKit
)
IndexErrorException
MolDraw2D
(
RDKit
)
ReactionPicklerException
(
RDKit
)
x
DiscreteValueVect
(
RDKit
)
InfoBitRanker
(
RDInfoTheory
)
MolDraw2DCairo
(
RDKit
)
RecursiveStructureQuery
(
RDKit
)
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
Int2Type
(
Queries
)
MolDraw2DQt
(
RDKit
)
ResonanceMolSupplier
(
RDKit
)
XOrQuery
(
Queries
)
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
Invariant
(
Invar
)
MolDraw2DSVG
(
RDKit
)
RGroupDecomposition
(
RDKit
)
DistPicker
(
RDPickers
)
InversionContrib
(
ForceFields::UFF
)
MolDraw2Dwx
(
RDKit
)
RGroupDecompositionParameters
(
RDKit
)
DistViolationContrib
(
DistGeom
)
streambuf::istream
(
boost_adaptbx::python
)
MolDrawOptions
(
RDKit
)
RingInfo
(
RDKit
)
a
|
b
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c
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d
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e
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f
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g
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h
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k
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Generated on Mon Mar 26 2018 11:18:47 for RDKit by
1.8.13